ГАПОУ «Байкальский базовый медицинский колледж МЗ РБ» активно участвовает в международном сотрудничестве. В октябре 2008 г. состоялась первая встреча руководства Байкальского медицинского колледжа и Баянхонгорского многопрофильного Политехнического техникума Монголии. Во время визита делегации в Монголию был подписан протокол намерений с губернатором Баянхонгорского аймака, обозначивший развитие международного экологического студенческого туризма, обучение монгольских студентов в Байкальском медицинском колледже, обмен коллективами для углубленного изучения деятельности учреждений здравоохранения и образования.